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1材料與方法
1.1材料
利用江蘇省農(nóng)業(yè)科學院蔬菜研究所十字花科項目組不結球白菜研究材料T青做父本進行轉育,得到F1代。2011年春,將雙親及F1代種植于江蘇省農(nóng)業(yè)科學院蔬菜研究所實驗田。對F1代植株進行自交,得到F2代,F(xiàn)1代單株與不結球白菜親本回交,得到BC1代。田間管理按常規(guī)方法進行。
1.2方法
1.2.1T青、結球白菜抗源CR、F1、F2及BC1。每個材料3次重復,每次重復30株,隨機排列,播種于50孔穴盤。待苗長到3~4片真葉時移栽營養(yǎng)缽,采用灌根法進行抗性鑒定。用移液器吸取1ml含5×107或1×108個孢子懸浮液10ml,澆注到寄主根際周圍,接菌6周后,洗凈根部泥土,調查單株發(fā)病情況,并計算病情指數(shù)。田間病情分級參考前人研究分級標準[3],略有改動。分級標準為:0級,未發(fā)生病害;1級,根系的須根、側根有較少細小腫瘤,主根未發(fā)生病害;2級,根系的須根腫瘤多,側根腫瘤較多,主根發(fā)病較輕,微微腫大;3級,根系的主根發(fā)病較重,異常腫大,大部分須根、側根腫瘤多;4級,根系的主根異常腫大,根系幾乎無須根。0級為抗病,其他均為感病。
1.2.2抗感池的構建及引物篩選采用BSA法,在F2群體中分別隨機選取10株抗病單株和10株感病單株,將其DNA等量混合,構建抗病基因池和感病基因池,對引物進行篩選,挑選在抗、感病池間能夠產(chǎn)生特異性條帶的引物。
1.2.3PCR產(chǎn)物點入含0.5μg/mlEB的2.0%瓊脂糖凝膠中,以DNAmarkerV(Tiangen)作為分子量標準,在2.0%瓊脂糖凝膠中電泳1h,紫外凝膠成像儀下照相。
1.2.4ISSR標記的連鎖分析將篩選出的ISSR標記在雙親及F2分離群體中進行驗證,用2.0%瓊脂糖凝膠電泳檢測。親本為抗病有標記帶和感病無標記帶,F(xiàn)1代為感病有標記帶,F(xiàn)2代中重組型個體為抗病無標記帶、雜合感病無標記帶和純合感病有標記帶,根據(jù)F2代中重組型單株的數(shù)量計算交換率,再根據(jù)Kosambi作圖函數(shù)公式換算成Morgan遺傳距離。
2結果
2.1F1共接種30株,表現(xiàn)為高抗根腫病(抗性等級為0級)。F2隨機選取73株,54株表現(xiàn)為高抗(抗性等級為0級),其他感病(1株病級為1級,2株病級為2級,16株病級達3級),抗感分離比為54∶19,滿足3∶1(χ2=0.074<χ20.05=3.84)。BC1隨機選取70株,36株表現(xiàn)為高抗(抗性等級為0級),34株感病(2株病級1級,1株病級2級,31株病級達3級),抗感分離比為36∶34,滿足1∶1(χ2=0.057<χ20.05=3.84)。分析各病級范圍內(nèi)的單株頻數(shù),未發(fā)現(xiàn)4級病害的單株。表明該根腫病的抗性受顯性單基因控制。
2.2分子標記的篩選用90條ISSR引物進行親本PCR擴增,其中21條ISSR引物可以在親本間穩(wěn)定擴增出清晰多態(tài)性條帶,占總引物數(shù)的23.0%。將能夠擴增到清晰多態(tài)性條帶的引物在抗感池中篩選,結果發(fā)現(xiàn),引物873(5''''-GA-CAGACAGACAGACA-3'''')可以在抗感基因池中擴增出多態(tài)性條帶,差異片段分別約為500bp。由于抗根腫病基因是顯性基因,如果標記與抗病基因緊密連鎖,純合抗病株和雜合抗病株都能擴增出此帶,而純合感病株應沒有此帶。利用F2分離群體中的73個單株DNA對候選引物進一步驗證,結果顯示,標記873在54份高抗根腫病單株(抗性0級)中,53個擴增出差異條帶,1個未擴增出差異條帶。同樣19份感病單株中,有6份擴增產(chǎn)生特異條帶。因此共有7株在標記873與抗病基因之間發(fā)生重組,交換率為9.59%。依據(jù)Kogambi圖函數(shù)公式得出標記873與抗根腫病基因之間的遺傳距離為9.72cM,命名為CR-873。
3討論
在B.rapa中發(fā)現(xiàn)了至少3個主要的根腫病抗性基因,這些基因是相對獨立的,且分別對不同的P.brassicae生理小種發(fā)生作用[12-14]。Diederichsen等利用ECD04和DH群體發(fā)現(xiàn)了B.napus根腫病抗性由1個主效基因和至少2個隱性基因控制[15]。王芳展等認為,B.rapa大多數(shù)抗性基因都來自于歐洲飼料蕪菁,不同的品種獲得了1個或者多個的抗性基因,而這些基因之間又相對保持獨立[16]。本研究通過對抗根腫病多世代群體進行抗性鑒定表明,不結球白菜抗性由顯性單基因控制。Matsumoto等發(fā)現(xiàn)了2個RFLP標記與1個CR基因CRa連鎖,并將其定位在R3染色體34cM的位置上[17]。Suwabe等利用SSR標記,發(fā)現(xiàn)了Crr1和Crr22個CR位點[18]。Kuginuki等利用Siloga作為抗源,發(fā)現(xiàn)了3個RAPD標記與CR位點連鎖[19]。ISSR技術可以比RFLP、SSR、RAPD等技術更多地揭示基因組中的多態(tài)性,并比RAPD穩(wěn)定,比AFLP簡便,是一種很好的DNA指紋標記。本研究采用BSA和ISSR技術相結合來研究與不結球白菜抗根腫病基因連鎖的標記,得到1個與根腫病抗性基因連鎖較緊密的分子標記CR-873,遺傳距離為9.72cM。本研究中得到的CR-873標記與抗根腫病基因的遺傳距離仍然較遠,可能是因為本研究中用于計算遺傳距離的群體偏小,一定程度上影響遺傳距離的準確性。后續(xù)研究可以進一步擴大群體并把獲得的可能與抗根腫病基因相連鎖的ISSR標記轉換為更穩(wěn)定的SCAR標記。
作者:劉藍單位:河北省農(nóng)業(yè)局